巨型南瓜的主要病害有白粉病、病毒病、霜霉病等。虫害主要是蚜虫、白粉虱、斑潜蝇等。

1.物理防治

       ①在南瓜坐定后，底下垫泡沫板等材料，避免瓜底部被害虫咬噬或一些腐烂性病害发生。②悬挂黄板、蓝板防治蚜虫、白粉虱、潜叶蝇，悬挂高度要在距离叶片高度15～30 cm 位置， 每隔2～3 m 悬挂一张，不可过高，过高会影响预防效果。③及时打掉老化的黄叶和开败的花，防止因湿度大而引发霉变。

2.化学防治

         巨型南瓜的主要病害有白粉病、病毒病、霜霉病等。

（1）白粉病

         受害时叶片或嫩茎出现白色霉斑，严重时整个叶片布满白粉，10～30 ℃均可发病，最适温度20～25 ℃，高温干燥和潮湿交替病害发展迅速。可选用2％加收米（春雷霉素）水剂600 倍稀释液，或25％阿米西达（嘧菌酯）悬浮剂，或10％世高（苯醚甲环唑）水分散粒剂8 000 倍稀释液，或50％翠贝（醚菌酯） 干悬浮剂3 000～4 000 倍稀释液防治，交叉使用，连喷3～4 次。

（2）病毒病

         夏季高温极易产生病毒为害， 其主要靠蚜虫类等刺吸式口器昆虫进行取食传播病毒，应以防为主， 综合防治。防治药剂通常有盐酸吗啉胍、病毒A、稼典利、32％核苷·溴·吗啉胍、抗病威等，由于其主传播来源，同时还需施加吡虫啉、阿维菌素、啶虫脒等杀虫药剂进行预防和防治携带病毒者。在通常情况下，若病毒病不严重，一般用上述任何一种药剂防治3 次即可， 但若病情严重并且环境条件又不利于瓜苗生长时， 应需及早拔除病害严重的植株。

（3）霜霉病

         温室、大棚温度在15～25 ℃，相对湿度高于80％时很容易发病，当天气多雨、多露、多雾或是连续阴雨天气时，发病早而重。防治药剂可选用杜邦克露、霜霉威盐酸盐、杀毒矾等进行预防和防治。

（4）虫害防治

        温室内南瓜栽培害虫主要是蚜虫、白粉虱、斑潜蝇等。蚜虫繁殖力强，一年可发生10～30 个世代，世代重叠现象突出，群集于植物叶背面、嫩茎、生长点和花上，吸食汁叶，严重时植株停止生长，甚至全株萎蔫枯死；白粉虱繁殖力强，能孤雌繁殖，种群增长快，群聚危害，被害叶片退绿、变黄、萎蔫，甚至全株枯死；斑潜蝇发生规律在北方地区年可发生8～10 代， 其中保护地发生4～5 代， 保护地4—6 月初和10—11 月世代重叠严重。防治药剂可选用苦参碱、除虫菊素、扑虱灵、甲维盐、氯氟氰菊酯、灭蝇胺、吡虫啉、啶虫脒或是异丙威烟熏剂等进行预防和防治。